Pestisit kullanımının hem insan sağlığı hem de çevre üzerinde çeşitli yan etkileri olabilir. Öncelikle pestisitlere maruz kalma insanlarda akut ve kronik sağlık sorunlarına yol açabilmektedir. Kısa vadeli etkiler arasında cilt tahrişi, göz tahrişi, mide bulantısı, baş dönmesi ve baş ağrıları sayılabilir. Bazı pestisitlere uzun süreli maruz kalma, kanser, üreme bozuklukları, nörolojik bozukluklar ve solunum sorunları gibi daha ciddi sağlık sorunlarıyla ilişkilendirilmiştir.
Ayrıca pestisitlerin çevreye de zararlı etkileri olabiliyor. Akış veya sürüklenme yoluyla toprağı, su kütlelerini ve havayı kirletebilirler. Bu kirlenme, bu ekosistemlerdeki bitki ve hayvanlara zarar verebilir ve doğal yaşam alanlarının dengesini bozabilir. Pestisitler ayrıca tozlaşma için hayati önem taşıyan arılar gibi faydalı böcekleri öldürerek istenmeyen sonuçlara da yol açabilir.
Bu yan etkileri azaltmak için pestisitlerin doğru uygulama tekniklerini ve güvenlik önlemlerini takip ederek akılcı bir şekilde kullanılması önemlidir. Ek olarak, entegre haşere yönetimi (IPM) gibi alternatif haşere kontrol yöntemlerinin araştırılması, haşereleri etkili bir şekilde yönetirken kimyasal pestisitlere olan bağımlılığın azaltılmasına yardımcı olabilir.